Another interpretation: Three offerings, corresponding to the three times in the year that they collect from the chamber. Rabbi Yehoshua ben Levi said: A person who wished could give three shekels three times in the year, as it is said, "And we imposed upon ourselves commandments, to give yearly the third of a shekel" (Nehemiah 10:33). But was it not said only "half a shekel" (Exodus 30:13)? Rather, it speaks only of these three offerings.
Three Offerings and the Three Annual Collections of the Chamber
Yalkut Shimoni on Torah 363:12
דָּבָר אַחֵר, שָׁלֹשׁ תְּרוּמוֹת, בְּשָׁלֹש פְּעָמִים בַּשָּׁנָה תּוֹרְמִין אֶת הַלִּשְׁכָּה. אָמַר רַבִּי יְהוֹשֻׁעַ בֶּן לֵוִי שֶׁאִם רָצָה אָדָם לְשָׁלֹשׁ שְׁקָלִים שָׁלֹשׁ פְּעָמִים בַּשָּׁנָה, שֶׁנֶּאֱמַר (נחמיה י, לג) "וְהֶעֱמַדְנוּ עָלֵינוּ מִצְוֹת לָתֵת עָלֵינוּ שְׁלִישִׁית הַשֶּׁקֶל", וַהֲלֹא לֹא נֶאֱמַר אֶלָּא (לקמן ל, יג) "מַחֲצִית הַשֶּׁקֶל", אֶלָּא לֹא אָמַר אֶלָּא שָׁלֹשׁ תְּרוּמוֹת הַלָּלוּ.