(Gen. 6:7:) "And the LORD said: I will blot out the man." What is the meaning of "I will blot out"? "I will cut off," "I will destroy," "I will kill," "I will make to perish" is not written here, but rather "I will blot out." Rabbi Berekhiah said: The upper ones are water within water, and the lower ones are dust and ashes. And what is the way of water? It comes down upon the dust and blots it out. The Holy One, blessed be He, said: Since the dust have rebelled against Me, behold, I am bringing down upon it water and blotting it out, as it is said (Gen. 6:7): "And the LORD said: I will blot out."
Why God Said I Will Blot Out the Generation of the Flood
Midrash Tanchuma Buber, Noach 4:2
ויאמר ה' אמחה את האדם (שם ו ז). מהו אמחה, אכרות אשמיד אהרוג אאביד אין כתיב כאן, אלא אמחה, אמר ר' ברכיה העליונים מים במים, והתחתונים עפר ואפר, ומה עסקן של מים יורדין על העפר וממחין, אמר הקב"ה הואיל ומרדו בי העפר, הריני מוריד עליו מים וממחה אותו, שנאמר ויאמר ה' אמחה.